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應用纖維素酶現在已廣泛地應用于紡織、日用化工、造紙、食品發酵、工業洗滌、煙草、石油開采、廢水處理及飼料等各個領域，其應用前景十分廣闊。天然纖維素酶存在于微生物、某些昆蟲和植物中。植物種子萌發時，纖維素酶水解種皮纖維素，利于出苗。草食反芻動物內的共生細菌和原生動物能分泌纖維素酶，將纖維素水解為可被吸收的糖。利用微生物分泌的纖維素酶進行農副產品加工，可生產優質飼料和葡萄糖。農業上應用綠色木霉(富含纖維素酶的一種真菌)進行飼料發酵，可提高纖維素類飼料的Chemicalbook營養價值。

肉雞日糧一般以高魚粉、高玉米、高豆粕為主。為減少這些常規原料的使用量，廣泛采用廉價的飼料原料，秦江帆等（1996）在肉雞日糧中提高富含纖維的麥麩比例，添加0、0.05%、0.1%纖維素酶制劑進行試驗，結果表明，添加0.1%纖維素酶組比對照組在1-2、3-6、7-8周三個生長階段日增重分別提高4.31%、4.54%、4.13%，耗料比分別下降1.56%、4.50%、4.3%。徐奇友（1998）在蛋雞日糧中添加0.1%、0.15%、0.5%纖維素酶，結果表明，在1-10月的產蛋期間，產蛋率分別提高0.53%、1.25%、2.88%，酶水平0.15%和0.5%組的破蛋率降低34.49%、16.19%，蛋殼強度分別提高14.71%和8.41%。